Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Johan Bengtsson-Palme

Forskarassistent

Johan Bengtsson-Palme
Forskarassistent
Akademisk grad: Doktor,
johan.bengtsson-palme@gu.se
0733-661598

Postadress: Su sahlgrenska, 41345 Göteborg
Besöksadress: Guldhedsgatan 10 , 41346 Göteborg


Avd för infektionssjukdomar vid Institutionen för biomedicin (Mer information)
Box 480
405 30 Göteborg
0313421000
Besöksadress: Guldhedsgatan 10 A-B , 413 46 Göteborg

Om Johan Bengtsson-Palme

Min forskning handlar om mikrobiologi och mikrobiell ekologi, med särskild inrikting på antibiotikaresistens hos bakteriesamhällen. För att undersöka detta använder vi bioinformatik och metagenomik, dvs storskalig sekvensering av DNA från alla bakterier i ett prov.

Jag har tidigare jobbat med toxikologiska frågeställningar, framför allt i marina bakteriesamhällen, med samma metodik som vi ni använder för att undersöka antibiotikaresistens. Jag har också ett intresse för mikrobiell taxonomi och utveckling av metoder för bättre taxonomiska bestämningar utifrån sekvensdata. Besök gärna min hemsida http://microbiology.se för mer information!

Senaste publikationer

Strategies to reduce or eliminate resistant pathogens in the environment
Johan Bengtsson-Palme, Stefanie Hess
Antibiotic Drug Resistance, John Wiley & Sons, Kapitel i bok 2020
Kapitel i bok

Mumame: A software tool for quantifying gene-specific point-mutations in shotgun metagenomic data
Shruthi Magesh, Viktor Jonsson, Johan Bengtsson-Palme
Metabarcoding and Metagenomics, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2019
Artikel i vetenskaplig tidskrift

How next-generation sequencing can address the antimicrobial resistance challenge
Etienne Ruppé, Johan Bengtsson-Palme, Yannick Charretier, Jacques Schrenzel
AMR Control, Artikel i övriga tidskrifter 2019
Artikel i övriga tidskrifter

Industrial wastewater treatment plant enriches antibiotic resistance genes and alters the structure of microbial communities
Johan Bengtsson-Palme, M. Milakovic, H. Švecová, M. Ganjto, V. Jonsson et al.
Water Research, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2019
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Introducing ribosomal tandem repeat barcoding for fungi
Christian Wurzbacher, Ellen Larsson, Johan Bengtsson-Palme, Silke Van den Wyngaert, Sten Svantesson et al.
Molecular Ecology Resources, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2019
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Assessment and management of risks associated with antibiotic resistance in the environment
Johan Bengtsson-Palme
Management of Emerging Public Health Issues and Risks: Multidisciplinary Approaches to the Changing Environment, London, UK, Academic Press, Elsevier, Kapitel i bok 2019
Kapitel i bok

Diarrheal bacterial pathogens and multi-resistant enterobacteria in the Choqueyapu River in La Paz, Bolivia
J. Guzman-Otazo, Lucia Gonzales-Siles, V. Poma, Johan Bengtsson-Palme, K. Thorell et al.
PLoS ONE, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2019
Artikel i vetenskaplig tidskrift

The UNITE database for molecular identification of fungi: handling dark taxa and parallel taxonomic classifications.
R. Henrik Nilsson, Karl-Henrik Larsson, Andy F S Taylor, Johan Bengtsson-Palme, Thomas S Jeppesen et al.
Nucleic acids research, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2019
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Structure and function of the global topsoil microbiome
M. Bahram, F. Hildebrand, S. K. Forslund, J. L. Anderson, N. A. Soudzilovskaia et al.
Nature, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2018
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Visar 51 - 60 av 66

2014

BacMet: antibacterial biocide and metal resistance genes database
Chandan Pal, Johan Bengtsson-Palme, Christopher Rensing, Erik Kristiansson, D. G. Joakim Larsson
Nucleic Acids Research, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2014
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Improving ITS sequence data for identification of plant pathogenic fungi
R. Henrik Nilsson, Kevin D. Hyde, Julia Pawłowska, Martin Ryberg, Leho Tedersoo et al.
Fungal diversity, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2014
Artikel i vetenskaplig tidskrift

2013

Improved software detection and extraction of ITS1 and ITS2 from ribosomal ITS sequences of fungi and other eukaryotes for analysis of environmental sequencing data
Johan Bengtsson-Palme, Martin Ryberg, Martin Hartmann, Sara Branco, Zheng Wang et al.
Methods in Ecology and Evolution, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2013
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Towards a unified paradigm for sequence-based identification of fungi.
Urmas Kõljalg, R. Henrik Nilsson, Kessy Abarenkov, Leho Tedersoo, Andy F S Taylor et al.
Molecular ecology, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2013
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Metaxa, overview
Johan Bengtsson-Palme, Martin Hartmann, Karl Martin Eriksson, R. Henrik Nilsson
Encyclopedia of Metagenomics, Berlin, Springer, Kapitel i bok 2013
Kapitel i bok

2012

Megraft: A software package to graft ribosomal small subunit (16S/18S) fragments onto full-length sequences for accurate species richness and sequencing depth analysis in pyrosequencing-length metagenomes
Johan Bengtsson-Palme, Martin Hartmann, Martin Unterseher, Parag Vaishampayan, Kessy Abarenkov et al.
Research in Microbiology, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2012
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Five simple guidelines for establishing basic authenticity and reliability of newly generated fungal ITS sequences
R. Henrik Nilsson, L Tedersoo, K Abarenkov, M Ryberg, Erik Kristiansson et al.
MycoKeys, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2012
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Visar 51 - 60 av 66

Sidansvarig: Evelyn Vilkman|Sidan uppdaterades: 2017-08-28
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?